ECサイトの決済代行サービスは、クレジットカード決済やコンビニ決済、QRコード決済などをまとめて導入できるサービスです。
ただし、対応する決済方法や手数料、ECカートとの連携方法、入金サイクルはサービスによって異なります。
この記事では、ECサイト向け決済代行サービスの料金・対応決済を一覧表で比較し、各サービスの特徴、選び方のポイントを解説します。
ECサイト向け決済代行サービスとは？
ECサイト向け決済代行サービスとは、EC事業者とクレジットカード会社などの決済事業者を仲介し、複数の決済方法を一括で導入・管理できるサービスです。
主に、ネットショップを新規開設する事業者や、既存ECサイトの決済方法を追加・変更する事業者に利用されています。
ShopifyやEC-CUBEなどのECカートを利用する事業者だけでなく、自社開発のECサイトを運営する企業も導入対象です。
EC決済代行サービスの主なサービス内容
EC決済代行サービスは、決済方法の導入から決済処理、売上管理、入金処理まで幅広い機能を提供しています。
主なサービス内容は以下のとおりです。
| サービス内容 | 詳細 |
| 決済方法の一括導入 | クレジットカードやコンビニ決済など、複数の決済方法をまとめて導入できます。 |
| 契約・審査手続きの代行 | 複数の決済事業者への申し込みや審査に必要な手続きを、決済代行会社を通じて進められます。 |
| 決済処理・売上管理 | 注文ごとの決済状況や売上を一元管理でき、キャンセル時の返金処理にも対応します。 |
| 売上金の精算・入金 | 各決済方法の売上を集計し、決済手数料などを差し引いた金額を指定口座に振り込みます。 |
| ECサイトとのシステム連携 | ECカートの連携アプリや決済プラグイン、APIなどを使って、ECサイトに決済機能を組み込めます。 |
| 追加機能の提供 | 定期購入の自動課金やカード決済時の本人認証、不正利用を検知する機能などを提供します。 |
EC決済代行サービスを利用するメリット
EC決済代行サービスを利用する主なメリットは、次の4つです。
- 契約・審査手続きの負担を軽減できる。
決済事業者ごとに個別契約を結ぶ必要がなく、複数の決済方法をまとめて申し込めます。 - 決済システムの接続先を一本化できる。
カード会社などと直接契約する場合は契約先ごとにシステム接続が必要になることがありますが、決済代行会社を利用すれば、複数の決済方法を共通のシステムで処理できます。 - 決済方法を簡単に追加できる。
決済代行会社が対応する決済方法なら、同じサービスを通じて追加を申し込めるため、新たな決済事業者との個別契約やシステム接続の手間を削減できます。 - 売上・入金管理を効率化できる。
複数の決済方法による売上や決済状況を一元管理でき、経理業務の負担を軽減できます。
ECサイト向け決済代行サービスの選び方
ECサイト向け決済代行サービスは、対応する決済方法、ECサイトとの連携方法、料金、入金サイクルの4つを基準に選びます。
同じ決済方法に対応していても、導入に必要な作業や費用、売上金が振り込まれるタイミングはサービスによって異なります。それぞれの確認ポイントを解説します。
商材・顧客層に必要な決済方法を導入できるか
ECサイトで取り扱う商品や顧客層によって、必要な決済方法は異なります。顧客が普段利用する支払い方法に対応しているかが重要です。
クレジットカード決済に加え、コンビニ決済、PayPayなどのQRコード決済、Amazon PayなどのID決済、後払い決済への対応を確認します。
また、定期購入やサブスクリプションを提供するECサイトでは、継続課金への対応も必要です。
決済方法の種類や選び方はこちらの記事をご確認ください。
ECカートの標準連携・プラグイン・API接続に対応しているか
決済代行サービスは、ECサイトの構築方法によって導入方法が異なります。ShopifyやEC-CUBEなどのECカートを利用している場合と、自社開発のECサイトでは、確認するポイントが異なります。
ECカートを利用する場合
ShopifyやEC-CUBE、makeshopなどのECカートを利用している場合は、標準連携や決済プラグイン、連携アプリに対応しているかを確認します。
対応している決済代行サービスなら、管理画面での設定や専用プラグインの導入によって決済機能を追加できます。
| サービス名 | Shopify | EC-CUBE | WooCommerce | Welcart | makeshop | カラーミーショップ | futureshop | ecforce |
| ROBOT PAYMENT（サブスクペイ） | 問合せ | 問合せ | 問合せ | 〇 | 問合せ | 問合せ | 問合せ | 問合せ |
| Square | 問合せ | 問合せ | 〇 | 問合せ | 問合せ | 問合せ | 問合せ | 問合せ |
| GMOイプシロン | 〇 | 〇 | 問合せ | 〇 | 〇 | 〇 | 問合せ | 〇 |
| ZEUS（ゼウス） | 問合せ | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 問合せ | 〇 |
| Stripe | 〇 | 〇 | 〇 | 問合せ | 問合せ | 問合せ | 問合せ | 問合せ |
| SP.LINKS | 問合せ | 〇 | 〇 | 〇 | 問合せ | 問合せ | 問合せ | 問合せ |
| SBペイメントサービス | 〇 | 〇 | 問合せ | 〇 | 問合せ | 問合せ | 〇 | 〇 |
| ペイジェント | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 問合せ | 問合せ |
自社開発のECサイトの場合
自社開発のECサイトでは、決済代行サービスが提供するAPIなどを使って決済システムを接続します。
主な接続方式は以下の3つです。クレジットカード決済を例に、それぞれの仕組みを説明します。
| 接続方式 | 購入者の操作 | 決済処理の仕組み | 開発の難易度 |
| データ伝送（API）型 | ECサイト上で カード情報を入力する | ECサイトのサーバーがカード情報を受け取り、 決済代行会社へ送信して決済する方式です。 | 高い。 決済画面の開発やAPI連携、セキュリティ対策が必要です。 |
| トークン（JavaScript）型 | ECサイト上で カード情報を入力する | カード情報をECサイトのサーバーを経由せずに 決済代行会社へ送り、代わりに発行される トークン（識別情報）を使って決済する方式です。 | 中程度。 決済画面へのJavaScriptの組み込みやシステム連携が必要です。 |
| リンク（画面遷移）型 | 決済代行会社のページに移動して カード情報を入力する | ECサイトから外部の決済ページへ移動し、 決済代行会社のシステム上で支払いを完了する方式です。 | 低い。 決済画面を自社開発する必要がなく、比較的少ない作業で導入できます。 |
カード情報を自社サーバーで扱うデータ伝送（API）型では、PCI DSSへの準拠などのセキュリティ対策も必要です。一方、トークン型とリンク型は、ECサイトのサーバーでカード情報を保持せずに決済できます。
開発負担を抑えるならリンク型、ECサイト内で決済を完結させるならトークン型、決済処理を細かくカスタマイズするならAPI型が選択肢になります。
決済手数料と総コストを確認する
決済代行サービスの料金は、決済手数料だけでなく、初期費用や月額費用、決済処理料なども含めて確認します。
特に、決済手数料は決済方法によって異なり、月間の決済額が大きい場合は料率が安くなることもあります。また、振込手数料、返金処理料、オプション料金が発生するサービスもあります。
そのため、公開されている料金だけで判断せず、複数の決済代行会社に見積もりを依頼することが重要です。
月間決済額や決済件数、利用予定の決済方法を伝え、同じ条件で見積もりを取得することで、実際にかかる総コストを確認できます。
入金サイクルを確認する
入金サイクルとは、ECサイトの売上金が決済代行会社から指定口座に振り込まれるまでの期間や頻度のことです。
サービスによって、翌営業日入金、月数回入金、月末締め翌月入金などの違いがあります。また、同じ決済代行サービスでも、決済方法によって入金日が異なる場合があります。
入金までの期間だけでなく、振込回数や振込手数料、早期入金オプションの有無も確認します。
ECサイト向け決済代行サービス比較12選
ECサイト向け決済代行サービスは、決済手数料だけで判断してはいけません。初期費用、月額費用、対応決済方法、入金サイクル、ECカート連携、セキュリティ対応まで含めて比較しましょう。
| サービス名 | イメージ | 初期費用 | 月額費用 | 決済手数料 | カード決済 | コンビニ決済 | ID決済 | キャリア決済 | 後払い決済 | 銀行振込 | ECカート連携 | セキュリティ | 入金サイクル |
| ROBOT PAYMENT （サブスクペイ） |  | 資料で確認 | お問合せ | 決済:2.5%~ 口座振替:85円~ | 〇 | 〇 | △ | お問合せ | △ | 〇 | 〇 | 〇 (Pマーク/ISMS取得) | お問合せ |
| Square |  | 0円 ※無料 無料アカウント登録 | 0円～ ※無料 | 3.6％ ※継続課金:3.75％ | 〇 | ✕ | △ | ✕ | ✕ | ✕ | 〇 | 〇 | 最短即時入金 三井住友・みずほ：翌営業日 その他：週1回 |
| Paysys |  | 0円~ | 0円~ | 3.3%~ | 〇 | 〇 | ✕ | ✕ | ✕ | ✕ | 〇 | 〇 | 月1～2 |
| GMOイプシロン |  | 0円 ※無料 | 2,980円 ※ビギナー | 3.6% ※ビギナー | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 月1回 ※早期入金サービス有 |
| ZEUS（ゼウス） |  | お問合せ | お問合せ | お問合せ | 〇 | 〇 | お問合せ | お問合せ | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 月1回 ※早期入金サービス有 |
| Stripe |  | 0円 ※無料 | 0円 ※無料 | 国内カード:3.6% コンビニ決済:3.6% PayPay:3.98% | 〇 | 〇 | 〇 | お問合せ | △ | 〇 | 〇 | 〇 | 週次自動・月次自動・手動 |
| SP.LINKS |  | お問合せ | お問合せ | お問合せ | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | お問合せ |
| SBペイメントサービス |  | お問合せ | お問合せ | お問合せ | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | お問合せ |
| ペイジェント |  | お問合せ | お問合せ | お問合せ | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 月1回締め ※早期入金オプション有 |
[orend-service]{“condition”:{“categoryId”:”00059″},”display”:{“type”:”price-explanation”}}[/orend-service]
GMOイプシロン
- 全プランEMV 3Dセキュア0円
- 初期費用・処理料0円
- 専任オペレーターがサポート
GMOイプシロンは、中小EC向けに利用される決済代行サービスです。
Shopify、EC-CUBE、makeshop、カラーミーショップなど、主要ECカートを利用している事業者で候補になります。クレジットカード決済に加え、コンビニ決済、PayPay、後払い、銀行振込などをまとめて確認できます。
| 項目 | 内容 |
| 初期費用 | 0円 |
| 月額費用 | ビギナープラン：2,980円 スタンダードプラン：5,980円 プレミアムプラン：9,980円 |
| 手数料 | ビギナー：3.6% スタンダード：2.99%〜 プレミアム：2.79%〜 |
| 対応決済 | クレカ(VISA・MasterCard・JCB・AMEX・Diners)、コンビニ・後払い(GMO後払い)、代引き・PayPal・Yahoo!ウォレット等 |
| 決済方式 | リンク型・メールリンク型 |
| 対応ECカート | Shopify・EC-CUBE・MakeShop・カラーミーショップ・おちゃのこネット・FC2ショッピングカート・Welcart・GMOクラウドEC・EC FORCE・Cafe24・Magento・WooCommerce等 |
| セキュリティ対策 | PCI DSS完全準拠・カード情報非保持化・EMV 3Dセキュア(全プラン0円)・セキュリティコード認証 |
| 入金サイクル | 月末締め・翌月20日入金(通常) ※早期入金サービス:翌月15日入金 ※随時入金サービス:最短3営業日(オプション) |
公式ホームページ:https://www.epsilon.jp/
ゼウス
- SBIグループの決済代行会社
- PCI DSS準拠の強固なセキュリティ
- ECと実店舗の一元管理が可能
ゼウスは、オンライン決済と対面決済の両方に対応する決済代行サービスです。クレジットカード決済、コンビニ決済、銀行振込、口座振替、キャリア決済、後払いなどに対応しています。
リンク型、トークン型、API型、メールリンク型など複数の接続方式を選べるため、自社ECの構築方法に合わせて導入できます。ECサイトと実店舗の決済を併用する事業者でも検討できます。
| 項目 | 内容 |
| 初期費用 | 問い合わせ |
| 月額費用 | 問い合わせ |
| 手数料 | 問い合わせ |
| 対応決済 | クレジットカード・コンビニ決済、銀行振込・ペイジー・口座振替、キャリア決済・電子マネー・あと払い決済 |
| 決済方式 | リンク型・トークン型・データ伝送（API）型・メールリンク型 |
| 対応ECカート | EC-CUBE・各種ASPカート・サブスク系カート・BtoB系カート 他多数 |
| セキュリティ対策 | PCI DSS準拠・EMV 3-Dセキュア、セキュリティコード（CVV2/CVC2）、不正検知サービス、チャージバック保証サービス |
| 入金サイクル | 月1回（月末締め翌月末払い、または月末締め翌月20日払い） ※早期入金サービス有（月2回・月3回入金・オプション） |
公式ホームページ：https://www.cardservice.co.jp/service/businessmodel/product.html
Stripe
- 世界中の決済手段に対応
- API連携で柔軟なカスタマイズ
- 使った分だけの明瞭な料金体系
Stripeは、オンライン決済、サブスク、プラットフォーム決済、越境ECに対応する決済プラットフォームです。初期費用、月額料金はなく、国内カード決済は成功した取引1件あたり3.6％です。
API連携に強く、自社開発EC、SaaS、アプリ、マーケットプレイス、海外販売で利用できます。Checkout、Payment Links、請求書、継続課金など、販売方法に応じた機能を選べます。
| 項目 | 内容 |
| 初期費用 | 0円 |
| 月額費用 | 0円 |
| 手数料 | 国内カード：3.6% コンビニ決済：3.6% PayPay・LINE Pay：3.6% 銀行振込：3.6% ※事業規模に応じた割引あり |
| 対応決済 | クレジットカード・デビットカード、プリペイドカード・Apple Pay・Google Pay、コンビニ決済・PayPay・LINE Pay・銀行振込 |
| 決済方式 | REST API・Checkout（構築済みフォーム）、Payment Links（ノーコードリンク）・モバイルSDK |
| 対応ECカート | Shopify、WooCommerce、Wixなど多数のプラットフォームと連携可能 |
| セキュリティ対策 | PCI DSS準拠・Radar（機械学習による不正検知） 3Dセキュア・Radar for Fraud Teams（高度な不正対策） |
| 入金サイクル | 週次自動・月次自動・手動から選択可能 通常T+3営業日 ※日本では日次入金不可、Instant Payouts（即時入金）は日本未対応 |
公式ホームページ：https://stripe.com/jp
SP.LINKS
- カード会社とダイレクトネットワーク接続
- 平均1.0秒の高速レスポンス
- PCI DSS準拠の万全セキュリティ
SP.LINKSは、クレジットカード決済、コンビニ決済、口座振替、電子マネー、キャリア決済などに対応する決済代行サービスです。多様な決済手段とカート連携、安定した決済処理を重視するECで候補になります。
EC-CUBEやWelcartなどのカート連携を確認できるため、既存のEC構築環境を活かして決済機能を追加する場合にも検討できます。
| 項目 | 内容 |
| 初期費用 | 問い合わせ |
| 月額費用 | 問い合わせ |
| 手数料 | 問い合わせ |
| 対応決済 | クレカ（国際6大ブランド）・コンビニ、オンラインID決済（PayPay・au PAY・d払い・メルペイ・・楽天ペイ・PayPal・WeChat Pay・Alipay+）、QRコード・口座振替、電子マネー（モバイルSuica・楽天Edy・JCB PREMO・支払秘書）、Google Pay・Apple Pay、Pay-easy・ネット銀行、キャリア決済・銀聯カード |
| 決済方式 | リンク型・API型（トークン型）・カード情報非通過型・メールリンク型 |
| 対応ECカート | EC-CUBE・Welcart・WooCommerce・CS-Cart・Magento・SOY Shop・Drupal・e-shopsカートS・侍カート等 |
| セキュリティ対策 | PCI DSS準拠・EMV 3Dセキュア、プライバシーマーク・ISMS（ISO/IEC27001）認証、カード情報お預かりサービス・不正検知サービス、認証アシストサービス・トークン決済・カード情報非通過化 |
| 入金サイクル | 問い合わせ |
公式ホームページ：https://www.splinks.co.jp
SBペイメントサービス
- 40ブランド以上の決済手段に対応
- 業界最大規模の取引高9.8兆円
- 20種類以上のECカートと接続済み
SBペイメントサービスは、ソフトバンクグループの決済代行サービスです。40ブランド以上の決済手段を提供しており、クレジットカード、PayPay、キャリア決済、コンビニ決済、楽天ペイなどに対応しています。
大規模EC、PayPayやキャリア決済を重視するEC、豊富な決済手段をまとめて導入する事業者で候補になります。取引規模が大きい場合は、サポート体制や不正対策も含めて確認してください。
| 項目 | 内容 |
| 初期費用 | 問い合わせ（業種・取扱高により異なる） |
| 月額費用 | 問い合わせ（業種・取扱高により異なる） |
| 手数料 | 問い合わせ（決済手数料・決済サービス利用料・トランザクション費用が発生） |
| 対応決済 | クレカ・QRコード決済(PayPay・楽天ペイ等)、キャリア決済・コンビニ・後払い、銀行振込・電子マネー等40ブランド以上 |
| 決済方式 | リンク型・API型・メールリンク型 |
| 対応ECカート | Shopify・futureshop・ecforce・ebisumart・W2 Repeat・aiship・楽楽リピート・サブスクストア・Cafe24・おちゃのこネット・e-shopsカートS・shop by・cago cloud・リピストX・aLe・W2 Unified・EC Direct・ウルトコ・Smile Tools・SNAPEC-EX等20種類以上 |
| セキュリティ対策 | PCI DSS準拠・ISMS認証取得・EMV 3-Dセキュア(有償)・AI不正検知(無償)・カード情報お預かりサービス |
| 入金サイクル | 問い合わせ |
公式ホームページ:https://www.sbpayment.jp/
ペイジェント
- NTTデータと三菱UFJニコスの合併会社
- BtoB・BtoC・サブスク対応
- 専任担当による充実サポート
ペイジェントは、NTTデータと三菱UFJニコスの合併会社が提供する決済代行サービスです。早期入金オプションでは、締め日より最短5営業日後の入金に対応しています。
銀行振込、コンビニ決済、口座振替、メールリンク決済などを組み合わせたいECで候補になります。見積販売や法人取引など、購入前に金額が確定する販売方法でも利用できます。
| 項目 | 内容 |
| 初期費用 | 問い合わせ |
| 月額費用 | 問い合わせ |
| 手数料 | 問い合わせ |
| 対応決済 | クレジットカード・コンビニ決済・銀行ネット決済・ATM決済・銀行仮想口座 |
| 決済方式 | リンク型・メール決済・システム連携 |
| 対応ECカート | Shopify・EC-CUBE・WordPress（WooCommerce）・W2・Dai・メクマ・ecbeing・SI Web Shopping・楽楽販売 他多数 |
| セキュリティ対策 | 問い合わせ |
| 入金サイクル | 月1回締め（翌月9～10営業日後） ※早期入金オプション有（月2～4回締め・5～6営業日後） |
fincode byGMO
- GMOペイメントゲートウェイグループ
- 初期費用・月額費用0円
- エンジニアファーストの設計とAPI
fincode byGMOは、初期費用、月額費用0円で利用できるオンライン決済サービスです。カード決済手数料は3.6％です。
API連携を前提にした自社開発EC、スタートアップ、アプリ、プラットフォーム型サービスで候補になります。クレジットカード決済に加え、コンビニ決済、PayPay、口座振替、銀行振込なども利用できます。
| 項目 | 内容 |
| 初期費用 | 0円 |
| 月額費用 | 0円 |
| 手数料 | カード決済、Apple Pay、Google Pay：3.6% コンビニ決済：3.0%（最低150円/件） PayPay：物販3.6%/デジタルコンテンツ9.0% 口座振替・銀行振込：2.0%（最低130円/件） ※年間取引5億円以上は個別提案 |
| 対応決済 | クレジットカード・Apple Pay・Google Pay・コンビニ決済（PAYSLE）・PayPay・口座振替・銀行振込（バーチャル口座） |
| 決済方式 | トークン型・リダイレクト型 |
| 対応ECカート | 問い合わせ |
| セキュリティ対策 | PCI DSS準拠・EMV 3-Dセキュア・セキュリティコード・カード情報完全非保持化 |
| 入金サイクル | 月2回（15日・末日締め） |
公式ホームページ：https://www.fincode.jp/
PAY.JP
- 初期費用・トランザクション費用0円
- サポート満足度94.7%
- PCI DSS Version 4.0準拠
PAY.JPは、クレジットカード決済、Apple Pay、定期課金などに対応するオンライン決済サービスです。
カード決済を中心に導入するスタートアップ、アプリ、自社開発ECで候補になります。プランが複数あるため、月商が増えた段階で上位プランへ移行し、手数料率を下げる判断もできます。
| 項目 | 内容 |
| 初期費用 | 0円 |
| 月額費用 | スタンダード：0円 ビジネス：20,000円 エンタープライズ：50,000円 |
| 手数料 | スタンダード：3.3% ビジネス：2.78% エンタープライズ：Visa・Mastercard 2.59%、JCB・AMEX・Diners・Discover 2.7% |
| 対応決済 | クレカ（Visa・Mastercard・JCB・AMEX・Diners・Discover）、Apple Pay、定期課金（月額・年額） |
| 決済方式 | API型・トークン型 |
| 対応ECカート | EC-CUBE（専用プラグイン提供）・API連携可能なカート・アプリ |
| セキュリティ対策 | PCI DSS Version 4.0 Level 1準拠・EMV 3Dセキュア・トークン化 |
| 入金サイクル | 月1回（月末締め・翌月末入金）または月2回（15日締め→月末入金、月末締め→翌月15日入金） ※早期入金機能あり |
公式ホームページ：https://pay.jp/
KOMOJU
KOMOJUは、クレジットカード、コンビニ決済、スマホ決済、後払い、銀行振込など、65以上の決済方法に対応するオンライン決済代行サービスです。初期費用、月額費用が無料で、カード決済は3.25％、コンビニ決済は2.75％です。
ShopifyなどのECプラットフォームでコンビニ決済やスマホ決済を追加する場合に候補になります。週次または月次の入金サイクルを選べるため、資金繰りも確認してください。
詳細はこちら：https://ja.komoju.com/
まとめ｜EC決済代行はECカート・料金・入金・不正対策まで確認する
ECサイト向け決済代行サービスを選ぶ際は、決済手数料だけでなく、ECカートとの連携、必要な決済方法、初期費用・月額費用を含む総コスト、入金サイクル、EMV 3-Dセキュアや不正検知、越境ECへの対応まで確認しましょう。
料金が公開されていないサービスは、月商、決済件数、平均客単価、利用する決済方法などの条件を揃えて見積もりを取得すると、費用や契約条件の違いが分かります。
ECサイトに限定せず決済代行会社全体を確認する場合は、決済代行会社を総合比較で主要サービスを紹介していますのでぜひ参考にしてください。